水原三星夺得2008赛季K联赛冠军

2009年亚足联冠军联赛，水原三星对阵鹿岛鹿角赛前合影

水原三星队的吉祥物Aguileon

前韩国国家足球队教练金皓（英语：Kim Ho）是原三星的第一个K联赛赛季的教练。它们在参赛第一年就于季后赛获得了联赛亚军。水原队第一个联赛冠军是在1998年得到的，隔年卫冕成功，自那时开始；水原队确立其在韩国足坛的地位。

水原三星在2001年及2002年两度成为亚洲冠军杯冠军，水原三星在成立短短五年，就登上亚洲足坛的顶点。而水原队在这两年的亚洲超级杯也都得到冠军，如此证明，水原队在这两年度完全称霸亚洲足坛。

水原三星队上曾有许多韩国国家足球队阵中的明星球员，如李云在、金南一、宋钟国。其他K联赛著名外援也都效力过水原三星，如丹尼斯·拉克季奥诺夫（英语：Denis Laktionov）、萨沙·德拉库利奇（英语：Saša Drakulić）、佐兰·乌鲁莫夫（英语：Zoran Urumov）以及加布里埃尔·波佩斯库。

金和于2003年离开水原队，取代他的是大韩民国足球传奇车范根。球队的管理阶级都相信在他的带领之下，水原队可以再创佳绩，成为亚洲一流球队。

车范根上任隔年就带领球队赢得2004年K联赛下半季的冠军。同时也确保球队在季后赛的席位，最后水原三星在季后赛决赛中遇上浦项制铁；水原队在点球大战中，以4-3击败对手，赢得2004年赛季的总冠军。

2008年，水原三星在车范根的带领下，再一次夺得常规赛的冠军，最后在总决赛中客场1:1主场2:1击败首尔FC夺得总决赛冠军，并夺得当年的韩国联赛杯冠军随后有勇夺了泛太杯的冠军，成为三冠王。

2019年，水原三星于决赛以两回合总比分4-0击败韩国第三级别球队大田国铁捧杯。水原三星前后5次捧得南韩足总杯，也成为南韩足总杯夺冠次数最多的球队。

2023年，K联赛收官战，水原三星0-0战平江原FC，因进球数劣势排名垫底，历史首次降入K2联赛[1][2]。